云南省生态学会于1988年6月成立（云南省科委云科办（1988）第095号“省科委关于批准成立《云南省生态学会等三个学（协）会的批复》），它的前身是云南省植物学会生态地植物专业委员会。自学会成立以来一直致力于开展生态学基础理论和应用技术的综合研究，立足我国生物多样性高足度富集的云南省，探讨自然与人工生态系统的结构、功能与动态过程。鼓励生态学科技工作者应用生态学原理及技术，对云南省的生态文明建设和生态环境保护等重大问题开展专题研究，为振兴云南经济、保护和改善生态环境献计献策。

 学会的业务主管单位是云南省科协，登记管理机关是云南省民政厅，学会的挂靠单位是中国科学院西双版纳热带植物园，目前学会的领导机构为第八届理事会，理事长是杨永平研究员。中国科学院西双版纳热带植物园作为学会的挂靠单位，对学会建立稳定的办事机构起到了十分重要的作用。

 自学会成立至今，在云南省科协、中国生态学学会的指导下，在挂靠单位及各会员单位的大力支持下，学会充分发挥自身拥有的横向联合的优势，将活动重心放在学术交流、科技咨询和科普宣传上，主要活动效果看重社会效益。学会对外倡导开展公益活动，对内则构筑起会员单位之间学术交流的活动平台，为会及广大科技工作者提供学习交流的机会，让会员扩展思路、视野，增长知识和才平，从而提高工作技能和效率。